このインスタンスをv2.6.2にアップグレードしました。
このバージョンから自分のtootにリプライするかたちでtootをすると"Show thread"のリンクが自動で付加されてひとつのスレッドとして表示出来るようになりました。

This instance has been upgraded to v2.6.2
Add "Show thread" link to self-replies.